惠州市境县以下的基层行政区划，秦代县以下设乡、里、亭，10里为亭，10亭为乡。汉平南越后，县以下设乡、亭。晋代，县以下有乡、里，无亭。隋代，县以下为保、里、族。唐代，县以下设镇和乡、里，但在广东此时镇的建置尚未形成定制。唐武德中，令天下4家为邻，100户为里，5里为乡。邑居者为坊，野居者为村。宋代，县以下设镇（人口达到100户即为建镇的低人口限度），镇以下为乡、里。宋熙宁间，改乡、里为都、保。宋元丰间，废都、保，而复乡、里。元代，县以下基层建置仍为镇和乡、都，后改乡、里为都、图；城区仍为附廓。明代县以下政区是乡、里、甲制，乡下设都，都下设图，里图之下为甲。以110户为里。推丁粮多者10户为长，余100户为10甲。甲凡10人，岁役里长1人，甲首1人，董1里1甲之事（《明史。职官志》）。明代惠州府设有乡里192里（顾祖禹《读史方舆纪要》）；在城区，则实行朝邑制，城内曰坊，附城曰厢，为城市基层行政区划。清代县以下农村实行里社制，110户为1里、里下为甲，后又规定10户为1牌、10牌为1甲、10甲为1保；城市则仍照明代坊厢制。1909年（清宣统元年），清廷颁布《城镇乡地方自治章程》，规定府、州、县、厅治所驻在地的城厢为城，城厢以外的村镇屯集圩等聚落，5万人以上者为镇，5万人以下者称乡。


　　民国时期广东省县以下基层政区，按1931年国民政府规定，实行区-乡-里制，以25户为1里，40～100里为1乡镇。区公所为县政府派出机关，按地方范围大小、户口多寡、经济能力强弱，分为甲、乙、丙3类。1937年开始，实施县-乡（镇）二级制，县为一级，乡（镇）为另一级，而区为虚级。乡（镇）以下设保、甲，属治安管理性质组织。在城市则实行区坊制，500户为1坊，10坊为1区。


　　2003年6月，惠阳撤市设区，调整了惠州市行政区划，原惠阳市的陈江、潼湖、潼侨、沥林、水口、马安、横沥、矮陂、芦洲、大岚等10个镇的行政区域划归惠城区管辖，博罗县仍图镇划归惠城区后撤销并入汝湖镇；惠阳区辖下的镇有淡水、秋长、新圩、镇隆、沙田、永湖、良井、平潭共8个镇，惠阳区的霞涌、澳头办事处暂属惠州市大亚湾经济技术开发区管辖。至此，惠州市辖下有的行政区域有惠城区、惠阳区和惠东、博罗、龙门共2区3县。

　　土地类型多种多样，耕地、林地、草地、水面、滩涂样样齐全，利于农、林、牧、副、渔各业全面发展。水力资源也相当丰富。境内有集雨面积100平方公里以上的河流34条，总长约1500公里。


　　广东三大水系之一的东江、西枝江横贯其中。浅层地下水量33亿立方米，水质总体良好。是供给香港、深圳、广州等地的重要水源。水力资源理论蕴藏量60.32万千瓦，有很大开发潜力。海域中有浅海面积560.4平方公里，可供开发养殖面积137.33平方公里。海区内有鱼类400，贝类200多种，甲类100多种，刺皮类60多种，藻类30多种，具有较大的经济和捕捞价值。适宜建设海港码头的海岸线长28.4公里，可建泊位126个，其中万吨级以上深水泊位76个。惠州港为华南地区的天然优良深水港。


　　已探明储量的矿产有40多种，主要有无烟煤、铁矿石、锡矿、钨矿、钾长石、高岭土、铅十锌、萤虫石、石灰石等。铌钽、石灰石、水晶、汞等矿产储量居广东省前列。


　　惠州市森林资源丰富，2011年底惠州市森林覆盖率60.4%。